Mitä tietää
- FNA-tiedosto on FASTA-muotoinen DNA- ja proteiinisekvenssikohdistustiedosto.
- Avaa yksi Geneiousilla.
- Muunna FASTA-muotoon ja vastaaviin muotoihin samalla ohjelmalla.
Tässä artikkelissa kerrotaan, mikä FNA-tiedosto on, kuinka se avataan ja miten tiedosto tallennetaan eri muotoon, kuten FASTA, GB, VCF, kuvat jne.
Mikä on FNA-tiedosto?
FNA-tiedostotunnisteella varustettu tiedosto on FASTA-muotoinen DNA- ja proteiinisekvenssikohdistustiedosto, joka tallentaa DNA-tiedot, joita molekyylibiologian ohjelmistot voivat käyttää.
FNA-tiedostoja voidaan käyttää erityisesti vain nukleiinihappotietojen säilyttämiseen, kun taas muut FASTA-muodot sisältävät muuta DNA:han liittyvää tietoa, kuten FASTA, FAS, FA, FFN, FAA, FRN, MPFA, SEQ., NET tai AA tiedostopääte.
Nämä tekstipohjaiset FASTA-muodot syntyivät alun perin samannimisestä ohjelmistopaketista, mutta niitä käytetään nykyään standardina DNA- ja proteiinisekvenssien kohdistussovelluksissa.
FNA viittaa myös joihinkin teknisiin termeihin, joilla ei ole mitään tekemistä tämän tiedostomuodon kanssa, kuten lopullinen verkon hyväksyntä, tiedostonimen/attribuutin lisäystoiminto, Fujitsun verkkoarkkitehtuuri ja nopea naapurimainos.
FNA-tiedoston avaaminen
Avaa Windowsissa, macOS:ssä ja Linuxissa Geneiousin avulla (ilmainen 14 päivän ajan). Voit tehdä tämän siirtymällä Tiedosto > Import -valikkoon ja valitsemalla tiedoston tuomisen Tiedostostavalikkokohta.
Voit myös pystyä avaamaan sellaisen BLAST Ring Image Generatorilla (BRIG).
Kokeile Notepad++:aa tai muuta tekstieditoria, jos ideat eivät toimi. Tiedosto voi todellakin olla tekstipohjainen ja helppolukuinen, tai saatat huomata, että sillä ei ole mitään tekemistä FASTA-muodon kanssa, jolloin tiedoston avaaminen tekstidokumenttina voi paljastaa tekstiä, joka tunnistaa tiedoston luomiseen käytetyn tai missä muodossa tiedosto on.
FNA-tiedoston muuntaminen
Emme voi vahvistaa tätä, koska emme ole kokeilleet sitä, mutta sinun pitäisi pystyä muuntamaan tiedosto moniin muihin muotoihin Geneiousin avulla, kuten FASTA, GB, GENEIOUS, MEG, ACE, CSV, NEX, PHY, SAM, TSV ja VCF. Tämä voidaan tehdä ohjelman Tiedosto > Vie-valikon kautta.
Saman ohjelman pitäisi pystyä myös tallentamaan tiedosto PNG-, JPG-, EPS- tai PDF-muotoon File > Tallenna kuvatiedostona kautta..
Vaikka et yleensä voi vain nimetä tiedoston tunnistetta joksikin muuksi ja odottaa sen toimivan samalla tavalla, voit nimetä. FNA-tiedoston uudelleen. FA-tiedostoksi, jos tietty DNA-sekvensointiohjelmistosi tunnistaa vain FA-muoto.
Tiedostotunnisteiden uudelleennimeämisen sijaan sinun kannattaa käyttää ilmaista tiedostomuunninta muiden tiedostotyyppien muuntamiseen. FNA- ja FA-tiedostojen tapauksessa sattuu niin, että jotkin ohjelmat avaavat vain tiedostoja, joilla on FA-tiedostotunniste, jolloin uudelleennimeämisen pitäisi toimia hyvin.
Etkö vieläkään voi avata sitä?
Jos et vieläkään saa tiedostoa avautumaan ylhäältä ohjelmien käytön jälkeen, saatat huomata, että tiedostotunniste ei itse asiassa lue. FNA:ta, vaan sen sijaan jotain, joka näyttää samanlaiselta.
Esimerkiksi FNG (Font Navigator Group) -tiedostot näyttävät hirveän paljon siltä kuin ne sanoisivat ". FNA", mutta jos katsot tarkasti, vain kaksi ensimmäistä kirjainta ovat samat. Koska tiedostotunnisteet ovat erilaiset, se on merkki siitä, että ne ovat eri tiedostomuodossa eivätkä todennäköisesti toimi samojen ohjelmien kanssa.
Sama voidaan sanoa monista muista tiedostopäätteistä, kuten FAX, FAS (Compiled Fast-Load AutoLISP), FAT, FNTA (Aleph One Font), FNC (Vue Functions) ja FND (Windowsin tallennettu haku).
Ajatuksena tässä on vain varmistaa, että tiedostotunniste on. FNA. Jos näin käy, yritä uudelleen käyttää ylhäältä olevia ohjelmia sen avaamiseen tai muuntamiseen. Jos sinulla on toisenlainen tiedosto, tutki sen laajennusta saadaksesi selville, mitä sovelluksia sen avaamiseen tai muuntamiseen tarvitaan.
UKK
Kuinka avaat FNA-tiedoston Pythonissa?
Muunna ensin FNA-tiedosto FASTA-muotoon käyttämällä kolmannen osapuolen sovellusta, kuten Geneious. Sitten voit ladata Biopythonin, joukon vapaasti saatavilla olevia työkaluja biologiseen laskentaan bioinformatiikan työhön. Katso lopuksi Biopython-opetusohjelmasta ja keittokirjasta ohjeet FASTA-tiedostojen käsittelyyn.
Kuinka löydän FNA-valmistajan numerot Ancestry-raakatiedostosta?
Voit ladata useimmat DNA-tiedot osoitteesta Ancestry.com.txt-muodossa. Kuitenkin vain asiakkailla, joiden DNA on analysoitu seuraavan sukupolven sekvensoinnilla (NGS) on mahdollisuus ladata VCF-tiedosto. VCF-tiedoston lataaminen edellyttää DNA:n omistajaa, DNA-testausta NGS-tekniikalla ja laitteellasi on oltava vähintään 350 Mt vapaata tilaa.
